“十五”期間，我國基礎研究整體水平顯著提高，取得了一批重要成果，大幅提升了我國原始創(chuàng)新能力。 “十五”期間，我國基礎研究投入明顯增長，2001至2005年，全國基礎研究總投入469.3億元、年均增長25.1%，其中2005年達到135億元，較2000年的46.7億元增長了189.1%。 我國科技論文的數量和質量均有較大提高，國際學術地位顯著提升。2004年，SCI收錄的我國（大陸）科學論文數量居世界第5位，我國科學家在國際核心學術刊物上發(fā)表的論文數達到1443篇，較1996年的645篇有大幅度增長。這表明我國基礎研究正處在從量的擴張向質的提高的轉變時期。 我國形成了較為完整的基礎學科布局，一批新興交叉學科得到快速發(fā)展，納米科學等領域已進入世界先進行列，并建成了一批高水平的國家重點實驗室、重大科學工程等，出現(xiàn)了一批世界水平的創(chuàng)新團隊和科學家。 科技部基礎研究司司長張先恩表示，通過基礎理論的源頭創(chuàng)新推動技術創(chuàng)新，我國在納米科學、量子信息科學、生命科學等方面取得許多高水平研究成果，為未來高技術產業(yè)化發(fā)展奠定了基礎；而農業(yè)、能源、信息、資源環(huán)境、人口與健康等領域關鍵科學問題的研究對經濟社會可持續(xù)發(fā)展的作用也正日益顯露。 盡管我國基礎研究已取得長足發(fā)展，某些領域處在世界前沿，但有關專家表示，我國基礎研究與世界先進水平相比還存在較大差距。 我國基礎研究投入占研究與開發(fā)經費的比例仍偏低，多年徘徊在6%左右，而國際上創(chuàng)新型國家的這一比例通常為15%至20%；研究項目中人員費用比例過低；原始性創(chuàng)新成果和高質量論文仍較少；基礎研究隊伍整體水平有待提高，需要更多具有國際影響力的杰出科學家；科技資源共享程度低。 張先恩表示，國家采取了許多措施加強基礎研究，如先后設立了國家重點實驗室計劃、國家自然科學基金、973計劃等，使基礎研究條件不斷改善，但目前仍需解決一些現(xiàn)實問題。 此外，我國基礎研究的創(chuàng)新環(huán)境仍有待改善，急功近利的學術作風比較普遍，學術失范行為偶有發(fā)生，科學爭鳴和學術批評的氛圍亟待加強。 為此，國家已出臺了《關于進一步增強原始性創(chuàng)新能力的意見》《科學技術評價辦法》《國家重點基礎研究發(fā)展規(guī)劃項目管理暫行辦法》等政策措施，對改進科技評價體系、創(chuàng)造寬松的科研環(huán)境發(fā)揮了重要作用。 為落實《國家中長期科學和技術發(fā)展規(guī)劃綱要》，目前科技部正會同國家自然基金委等部門研究制訂《“十一五”國家基礎研究規(guī)劃》，力爭顯著提升我國原始創(chuàng)新能力。 “十一五”期間，我國基礎研究工作將部署六大任務，包括完善學科發(fā)展布局、穩(wěn)定發(fā)展基礎學科、高度關注和重點發(fā)展交叉學科；在基礎科學前沿領域，重點部署研究一批重大問題與重點方向；圍繞國家重大戰(zhàn)略需求，在10個領域進行重點部署；啟動蛋白質、量子調控、納米科學與技術、生殖與發(fā)育4個重大科學研究計劃；加強國家科學研究基地建設和科學研究基礎性工作；建設高水平的基礎研究隊伍。